MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Xanthomonas axonopodis pv. citri str. 306 chromosome

Total Repeats: 111185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003919	GATG	2	8	41	48	25 %	25 %	50 %	0 %	21240775
2	NC_003919	CCCG	2	8	86	93	0 %	0 %	25 %	75 %	21240775
3	NC_003919	TCG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
4	NC_003919	TCG	2	6	232	237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
5	NC_003919	CGGT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	21240775
6	NC_003919	CG	3	6	276	281	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
7	NC_003919	GC	3	6	316	321	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
8	NC_003919	GCA	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
9	NC_003919	GGC	2	6	416	421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240775
10	NC_003919	CA	3	6	457	462	50 %	0 %	0 %	50 %	21240775
11	NC_003919	TGC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
12	NC_003919	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
13	NC_003919	CGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
14	NC_003919	GCC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240775
15	NC_003919	TTC	2	6	582	587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240775
16	NC_003919	GAT	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240775
17	NC_003919	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
18	NC_003919	GCT	2	6	659	664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
19	NC_003919	CGA	2	6	668	673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
20	NC_003919	TTC	2	6	681	686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240775
21	NC_003919	TTC	2	6	714	719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240775
22	NC_003919	GCC	2	6	745	750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240775
23	NC_003919	ATC	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240775
24	NC_003919	CG	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
25	NC_003919	GCCTG	2	10	820	829	0 %	20 %	40 %	40 %	21240775
26	NC_003919	CCG	2	6	852	857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240775
27	NC_003919	CG	3	6	870	875	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
28	NC_003919	GC	3	6	894	899	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
29	NC_003919	GCG	2	6	904	909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240775
30	NC_003919	CGA	2	6	920	925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240775
31	NC_003919	AAG	2	6	945	950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240775
32	NC_003919	GC	3	6	979	984	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
33	NC_003919	TGG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240775
34	NC_003919	CTG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
35	NC_003919	AGA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240775
36	NC_003919	TAC	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240775
37	NC_003919	CTG	2	6	1146	1151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
38	NC_003919	GCG	2	6	1157	1162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240775
39	NC_003919	CGCT	2	8	1167	1174	0 %	25 %	25 %	50 %	21240775
40	NC_003919	GC	3	6	1176	1181	0 %	0 %	50 %	50 %	21240775
41	NC_003919	ACCAC	2	10	1264	1273	40 %	0 %	0 %	60 %	21240775
42	NC_003919	TGC	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240775
43	NC_003919	TGG	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240776
44	NC_003919	GC	3	6	1857	1862	0 %	0 %	50 %	50 %	21240776
45	NC_003919	GC	3	6	1880	1885	0 %	0 %	50 %	50 %	21240776
46	NC_003919	CGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240776
47	NC_003919	CAG	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240776
48	NC_003919	TGT	2	6	2116	2121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240776
49	NC_003919	TGC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240776
50	NC_003919	ATC	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240776
51	NC_003919	GC	3	6	2435	2440	0 %	0 %	50 %	50 %	21240776
52	NC_003919	GC	3	6	2524	2529	0 %	0 %	50 %	50 %	21240776
53	NC_003919	AGG	3	9	2542	2550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21240776
54	NC_003919	CGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240776
55	NC_003919	GTG	2	6	2652	2657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240776
56	NC_003919	CAG	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240776
57	NC_003919	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	21240777
58	NC_003919	TCG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240777
59	NC_003919	CTG	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240777
60	NC_003919	CAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240777
61	NC_003919	GTGGA	2	10	4012	4021	20 %	20 %	60 %	0 %	21240777
62	NC_003919	AAG	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240777
63	NC_003919	GCG	3	9	4028	4036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240777
64	NC_003919	GGCT	2	8	4059	4066	0 %	25 %	50 %	25 %	21240777
65	NC_003919	CT	3	6	4128	4133	0 %	50 %	0 %	50 %	21240777
66	NC_003919	TGCGC	2	10	4135	4144	0 %	20 %	40 %	40 %	21240777
67	NC_003919	GTG	2	6	4150	4155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240777
68	NC_003919	GGT	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240777
69	NC_003919	CGC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240777
70	NC_003919	AAC	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240777
71	NC_003919	GC	3	6	4313	4318	0 %	0 %	50 %	50 %	21240777
72	NC_003919	CCT	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21240777
73	NC_003919	GCGTGA	2	12	4527	4538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21240777
74	NC_003919	CAT	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240777
75	NC_003919	TGC	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240777
76	NC_003919	TCA	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240777
77	NC_003919	GCA	2	6	4851	4856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240777
78	NC_003919	CGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
79	NC_003919	TGC	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
80	NC_003919	GGT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240778
81	NC_003919	CGA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
82	NC_003919	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
83	NC_003919	GCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
84	NC_003919	GAA	2	6	5302	5307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240778
85	NC_003919	CGG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
86	NC_003919	CGG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
87	NC_003919	CGA	2	6	5361	5366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
88	NC_003919	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
89	NC_003919	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240778
90	NC_003919	CAG	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
91	NC_003919	AGC	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
92	NC_003919	CCGT	2	8	5560	5567	0 %	25 %	25 %	50 %	21240778
93	NC_003919	GGCGC	2	10	5607	5616	0 %	0 %	60 %	40 %	21240778
94	NC_003919	TCCT	2	8	5629	5636	0 %	50 %	0 %	50 %	21240778
95	NC_003919	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
96	NC_003919	GCG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
97	NC_003919	CGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
98	NC_003919	GGC	2	6	5707	5712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
99	NC_003919	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
100	NC_003919	CAT	2	6	5796	5801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240778
101	NC_003919	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21240778
102	NC_003919	CGG	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
103	NC_003919	CACC	2	8	5886	5893	25 %	0 %	0 %	75 %	21240778
104	NC_003919	GCG	2	6	5908	5913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
105	NC_003919	CG	3	6	5918	5923	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
106	NC_003919	CGA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
107	NC_003919	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
108	NC_003919	GC	3	6	6112	6117	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
109	NC_003919	CGAA	2	8	6143	6150	50 %	0 %	25 %	25 %	21240778
110	NC_003919	TCG	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
111	NC_003919	CG	3	6	6183	6188	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
112	NC_003919	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
113	NC_003919	GCG	2	6	6199	6204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
114	NC_003919	GC	3	6	6211	6216	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
115	NC_003919	CGC	2	6	6226	6231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
116	NC_003919	TCG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
117	NC_003919	CCGCAA	2	12	6354	6365	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	21240778
118	NC_003919	TGC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
119	NC_003919	CGA	2	6	6489	6494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
120	NC_003919	ACC	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240778
121	NC_003919	CAT	2	6	6525	6530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240778
122	NC_003919	TGA	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240778
123	NC_003919	CCGACG	2	12	6539	6550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21240778
124	NC_003919	CTG	3	9	6574	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
125	NC_003919	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240778
126	NC_003919	CTACAT	2	12	6624	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240778
127	NC_003919	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
128	NC_003919	GAC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
129	NC_003919	GCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
130	NC_003919	GCG	2	6	6739	6744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21240778
131	NC_003919	CGA	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21240778
132	NC_003919	TTG	2	6	6796	6801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21240778
133	NC_003919	CG	3	6	6831	6836	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
134	NC_003919	GCC	2	6	6885	6890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
135	NC_003919	CG	3	6	6981	6986	0 %	0 %	50 %	50 %	21240778
136	NC_003919	TGG	2	6	7034	7039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21240778
137	NC_003919	CCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21240778
138	NC_003919	TGC	2	6	7076	7081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240778
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251	NC_003919	GAA	2	6	12022	12027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21240783
252	NC_003919	GCT	2	6	12076	12081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21240783
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258	NC_003919	GC	3	6	12278	12283	0 %	0 %	50 %	50 %	21240783
259	NC_003919	GGTG	2	8	12336	12343	0 %	25 %	75 %	0 %	21240783
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262	NC_003919	CTT	2	6	12471	12476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21240783
263	NC_003919	CG	3	6	12488	12493	0 %	0 %	50 %	50 %	21240783
264	NC_003919	AGT	2	6	12557	12562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21240784
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395	NC_003919	ATC	2	6	18489	18494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21240791
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484	NC_003919	ACC	2	6	23163	23168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21240796
485	NC_003919	AGGTGC	2	12	23169	23180	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21240796
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487	NC_003919	GCCGAC	2	12	23225	23236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	21240796
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500	NC_003919	GC	3	6	23765	23770	0 %	0 %	50 %	50 %	21240796

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